征收基本农田应该是由批准的。法律规定了批准基本农田、基本农田以外的超过三十五公顷的土地以及其他土地超过七十公顷的情形。基本农田受到严格保护，所以批准机关也要求最高行政机关。
【法律依据】
《中华人民共和国土地管理法》第四十五条
征收下列土地的，由批准：
（一）基本农田；
（二）基本农田以外的耕地超过三十五公顷的；
（三）其他土地超过七十公顷的。
征收前款规定以外的土地的，由省、自治区、直辖市批准，并报备案。
征收农用地的，应当依照本法第四十四条的规定先行办理农用地转用审批。其中，经批准农用地转用的，同时办理征地审批手续，不再另行办理征地审批；经省、自治区、直辖市在征地批准权限内批准农用地转用的，同时办理征地审批手续，不再另行办理征地审批，超过征地批准权限的，应当依照本条第一款的规定另行办理征地审批。
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